Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLX3O43711 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TLX3O43711 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLX3O43711 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLX3O43711 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLX3O43711 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLX3O43711 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLX3O43711 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLX3O43711 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLX3O43711 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLX3O43711 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLX3O43711 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLX3O43711 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLX3O43711 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLX3O43711 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLX3O43711 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLX3O43711 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLX3O43711 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLX3O43711 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLX3O43711 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLX3O43711 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLX3O43711 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLX3O43711 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLX3O43711 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLX3O43711 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLX3O43711 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLX3O43711 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLX3O43711 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLX3O43711 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TLX3O43711 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLX3O43711 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLX3O43711 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLX3O43711 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLX3O43711 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLX3O43711 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLX3O43711 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLX3O43711 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLX3O43711 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TLX3O43711 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLX3O43711 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLX3O43711 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLX3O43711 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLX3O43711 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLX3O43711 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLX3O43711 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TLX3O43711 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLX3O43711 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLX3O43711 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLX3O43711 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLX3O43711 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLX3O43711 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLX3O43711 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLX3O43711 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLX3O43711 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLX3O43711 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLX3O43711 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLX3O43711 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLX3O43711 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLX3O43711 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLX3O43711 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TLX3O43711 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLX3O43711 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLX3O43711 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLX3O43711 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLX3O43711 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLX3O43711 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLX3O43711 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLX3O43711 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TLX3O43711 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLX3O43711 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLX3O43711 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLX3O43711 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLX3O43711 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLX3O43711 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLX3O43711 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLX3O43711 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLX3O43711 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLX3O43711 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TLX3O43711 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TLX3O43711 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLX3O43711 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLX3O43711 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLX3O43711 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLX3O43711 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLX3O43711 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLX3O43711 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLX3O43711 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLX3O43711 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLX3O43711 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLX3O43711 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms