Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1GO43497 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1GO43497 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1GO43497 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1GO43497 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms