Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRID2O43424 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRID2O43424 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRID2O43424 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRID2O43424 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRID2O43424 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRID2O43424 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRID2O43424 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRID2O43424 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRID2O43424 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRID2O43424 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRID2O43424 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRID2O43424 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRID2O43424 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRID2O43424 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRID2O43424 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRID2O43424 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRID2O43424 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRID2O43424 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRID2O43424 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRID2O43424 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRID2O43424 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRID2O43424 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRID2O43424 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GRID2O43424 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRID2O43424 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRID2O43424 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRID2O43424 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRID2O43424 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRID2O43424 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRID2O43424 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRID2O43424 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRID2O43424 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRID2O43424 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRID2O43424 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRID2O43424 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRID2O43424 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRID2O43424 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRID2O43424 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRID2O43424 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRID2O43424 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRID2O43424 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRID2O43424 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRID2O43424 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRID2O43424 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRID2O43424 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRID2O43424 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRID2O43424 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRID2O43424 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRID2O43424 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRID2O43424 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID2O43424 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID2O43424 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID2O43424 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID2O43424 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID2O43424 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID2O43424 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID2O43424 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRID2O43424 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRID2O43424 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRID2O43424 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRID2O43424 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID2O43424 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID2O43424 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID2O43424 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID2O43424 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID2O43424 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRID2O43424 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRID2O43424 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRID2O43424 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRID2O43424 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRID2O43424 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRID2O43424 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRID2O43424 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRID2O43424 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRID2O43424 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRID2O43424 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRID2O43424 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRID2O43424 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRID2O43424 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRID2O43424 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRID2O43424 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRID2O43424 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRID2O43424 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRID2O43424 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRID2O43424 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRID2O43424 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRID2O43424 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRID2O43424 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRID2O43424 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRID2O43424 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRID2O43424 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRID2O43424 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRID2O43424 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRID2O43424 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRID2O43424 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRID2O43424 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRID2O43424 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRID2O43424 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRID2O43424 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms