Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD3O43242 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD3O43242 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSMD3O43242 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD3O43242 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD3O43242 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD3O43242 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms