Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTLC1O15269 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTLC1O15269 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTLC1O15269 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPTLC1O15269 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTLC1O15269 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTLC1O15269 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTLC1O15269 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPTLC1O15269 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC1O15269 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC1O15269 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC1O15269 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms