Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA5O15230 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA5O15230 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA5O15230 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA5O15230 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA5O15230 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA5O15230 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA5O15230 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA5O15230 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms