Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARPC1BO15143 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC1BO15143 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC1BO15143 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARPC1BO15143 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARPC1BO15143 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms