Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms