Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBTB39O15060 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBTB39O15060 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBTB39O15060 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBTB39O15060 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB39O15060 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBTB39O15060 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBTB39O15060 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms