Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLD2O14939 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLD2O14939 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLD2O14939 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLD2O14939 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLD2O14939 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLD2O14939 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLD2O14939 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLD2O14939 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLD2O14939 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLD2O14939 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLD2O14939 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLD2O14939 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLD2O14939 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLD2O14939 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLD2O14939 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLD2O14939 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLD2O14939 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLD2O14939 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLD2O14939 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLD2O14939 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLD2O14939 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLD2O14939 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLD2O14939 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLD2O14939 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLD2O14939 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLD2O14939 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLD2O14939 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLD2O14939 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLD2O14939 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD2O14939 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD2O14939 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD2O14939 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD2O14939 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLD2O14939 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLD2O14939 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLD2O14939 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLD2O14939 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLD2O14939 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLD2O14939 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLD2O14939 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLD2O14939 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLD2O14939 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLD2O14939 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD2O14939 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD2O14939 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD2O14939 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLD2O14939 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLD2O14939 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLD2O14939 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLD2O14939 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLD2O14939 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLD2O14939 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLD2O14939 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLD2O14939 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLD2O14939 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLD2O14939 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLD2O14939 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLD2O14939 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLD2O14939 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLD2O14939 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLD2O14939 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLD2O14939 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLD2O14939 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLD2O14939 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLD2O14939 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLD2O14939 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLD2O14939 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PLD2O14939 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLD2O14939 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLD2O14939 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLD2O14939 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLD2O14939 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLD2O14939 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLD2O14939 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLD2O14939 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLD2O14939 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLD2O14939 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLD2O14939 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD2O14939 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD2O14939 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD2O14939 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD2O14939 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD2O14939 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLD2O14939 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLD2O14939 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLD2O14939 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLD2O14939 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLD2O14939 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLD2O14939 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLD2O14939 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms