Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GIPC1O14908 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GIPC1O14908 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GIPC1O14908 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GIPC1O14908 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GIPC1O14908 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GIPC1O14908 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms