Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOR1AO14656 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TOR1AO14656 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOR1AO14656 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOR1AO14656 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms