Protein–RNA interactions for Protein: O14617

AP3D1, AP-3 complex subunit delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3D1O14617 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3D1O14617 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP3D1O14617 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3D1O14617 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3D1O14617 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3D1O14617 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3D1O14617 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms