Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRPO00591 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRPO00591 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRPO00591 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRPO00591 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRPO00591 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRPO00591 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRPO00591 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRPO00591 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRPO00591 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRPO00591 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRPO00591 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRPO00591 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRPO00591 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRPO00591 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRPO00591 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRPO00591 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRPO00591 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRPO00591 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRPO00591 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRPO00591 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRPO00591 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRPO00591 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRPO00591 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRPO00591 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRPO00591 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRPO00591 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRPO00591 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRPO00591 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRPO00591 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRPO00591 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRPO00591 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRPO00591 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRPO00591 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRPO00591 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRPO00591 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRPO00591 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRPO00591 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRPO00591 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRPO00591 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRPO00591 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRPO00591 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRPO00591 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRPO00591 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRPO00591 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRPO00591 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRPO00591 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRPO00591 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRPO00591 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRPO00591 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRPO00591 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRPO00591 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRPO00591 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRPO00591 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRPO00591 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRPO00591 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRPO00591 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRPO00591 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRPO00591 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRPO00591 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRPO00591 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRPO00591 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRPO00591 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRPO00591 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRPO00591 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRPO00591 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRPO00591 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRPO00591 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRPO00591 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRPO00591 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRPO00591 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRPO00591 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRPO00591 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRPO00591 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRPO00591 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRPO00591 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRPO00591 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRPO00591 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRPO00591 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRPO00591 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRPO00591 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRPO00591 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRPO00591 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRPO00591 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRPO00591 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRPO00591 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRPO00591 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRPO00591 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRPO00591 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRPO00591 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRPO00591 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRPO00591 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRPO00591 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRPO00591 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRPO00591 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRPO00591 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRPO00591 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRPO00591 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRPO00591 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRPO00591 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms