Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DLL1O00548 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DLL1O00548 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DLL1O00548 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DLL1O00548 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DLL1O00548 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DLL1O00548 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DLL1O00548 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DLL1O00548 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DLL1O00548 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DLL1O00548 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DLL1O00548 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DLL1O00548 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DLL1O00548 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DLL1O00548 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DLL1O00548 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DLL1O00548 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DLL1O00548 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DLL1O00548 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DLL1O00548 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DLL1O00548 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DLL1O00548 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DLL1O00548 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DLL1O00548 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DLL1O00548 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DLL1O00548 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DLL1O00548 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DLL1O00548 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DLL1O00548 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DLL1O00548 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DLL1O00548 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DLL1O00548 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DLL1O00548 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DLL1O00548 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DLL1O00548 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DLL1O00548 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DLL1O00548 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DLL1O00548 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DLL1O00548 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DLL1O00548 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DLL1O00548 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DLL1O00548 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DLL1O00548 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DLL1O00548 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DLL1O00548 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DLL1O00548 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DLL1O00548 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DLL1O00548 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DLL1O00548 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DLL1O00548 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DLL1O00548 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DLL1O00548 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DLL1O00548 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DLL1O00548 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DLL1O00548 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DLL1O00548 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DLL1O00548 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DLL1O00548 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DLL1O00548 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DLL1O00548 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DLL1O00548 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DLL1O00548 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DLL1O00548 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DLL1O00548 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DLL1O00548 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DLL1O00548 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DLL1O00548 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DLL1O00548 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DLL1O00548 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DLL1O00548 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DLL1O00548 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DLL1O00548 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DLL1O00548 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DLL1O00548 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DLL1O00548 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DLL1O00548 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DLL1O00548 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DLL1O00548 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DLL1O00548 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DLL1O00548 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DLL1O00548 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DLL1O00548 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DLL1O00548 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DLL1O00548 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DLL1O00548 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DLL1O00548 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DLL1O00548 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DLL1O00548 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DLL1O00548 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DLL1O00548 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DLL1O00548 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DLL1O00548 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DLL1O00548 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DLL1O00548 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DLL1O00548 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DLL1O00548 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DLL1O00548 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DLL1O00548 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DLL1O00548 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DLL1O00548 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms