Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
O00370 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
O00370 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
O00370 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
O00370 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
O00370 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
O00370 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
O00370 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
O00370 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
O00370 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
O00370 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
O00370 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
O00370 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
O00370 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
O00370 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
O00370 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
O00370 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
O00370 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
O00370 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
O00370 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
O00370 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
O00370 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
O00370 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
O00370 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
O00370 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
O00370 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
O00370 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
O00370 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
O00370 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
O00370 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
O00370 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
O00370 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
O00370 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
O00370 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
O00370 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
O00370 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
O00370 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
O00370 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
O00370 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
O00370 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
O00370 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
O00370 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
O00370 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
O00370 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
O00370 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
O00370 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
O00370 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
O00370 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
O00370 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
O00370 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
O00370 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
O00370 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
O00370 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
O00370 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
O00370 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
O00370 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
O00370 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
O00370 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
O00370 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
O00370 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
O00370 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
O00370 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
O00370 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
O00370 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
O00370 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
O00370 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
O00370 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
O00370 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
O00370 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
O00370 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
O00370 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
O00370 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
O00370 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
O00370 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
O00370 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
O00370 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
O00370 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
O00370 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
O00370 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
O00370 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
O00370 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
O00370 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
O00370 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
O00370 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
O00370 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
O00370 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
O00370 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
O00370 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
O00370 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
O00370 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
O00370 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
O00370 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
O00370 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
O00370 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
O00370 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
O00370 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
O00370 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
O00370 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
O00370 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
O00370 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms