Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEN1O00255 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEN1O00255 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEN1O00255 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEN1O00255 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEN1O00255 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEN1O00255 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEN1O00255 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEN1O00255 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEN1O00255 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEN1O00255 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEN1O00255 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEN1O00255 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEN1O00255 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MEN1O00255 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MEN1O00255 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEN1O00255 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEN1O00255 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEN1O00255 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEN1O00255 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEN1O00255 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEN1O00255 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEN1O00255 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEN1O00255 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEN1O00255 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEN1O00255 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEN1O00255 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEN1O00255 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEN1O00255 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEN1O00255 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEN1O00255 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEN1O00255 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEN1O00255 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MEN1O00255 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEN1O00255 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEN1O00255 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEN1O00255 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEN1O00255 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEN1O00255 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEN1O00255 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEN1O00255 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEN1O00255 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEN1O00255 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEN1O00255 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEN1O00255 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEN1O00255 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEN1O00255 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEN1O00255 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEN1O00255 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEN1O00255 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEN1O00255 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEN1O00255 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEN1O00255 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MEN1O00255 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MEN1O00255 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEN1O00255 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEN1O00255 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEN1O00255 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEN1O00255 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MEN1O00255 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEN1O00255 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEN1O00255 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEN1O00255 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEN1O00255 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEN1O00255 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEN1O00255 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MEN1O00255 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEN1O00255 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEN1O00255 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEN1O00255 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MEN1O00255 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEN1O00255 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEN1O00255 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MEN1O00255 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEN1O00255 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEN1O00255 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEN1O00255 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEN1O00255 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEN1O00255 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEN1O00255 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MEN1O00255 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEN1O00255 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEN1O00255 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEN1O00255 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEN1O00255 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEN1O00255 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEN1O00255 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEN1O00255 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEN1O00255 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEN1O00255 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEN1O00255 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEN1O00255 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEN1O00255 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEN1O00255 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEN1O00255 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEN1O00255 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEN1O00255 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEN1O00255 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms