Protein–RNA interactions for Protein: M0QZC1

RNF225, RING finger protein 225, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF225M0QZC1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF225M0QZC1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF225M0QZC1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF225M0QZC1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF225M0QZC1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF225M0QZC1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF225M0QZC1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF225M0QZC1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.6 ms