Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
H7C1D1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
H7C1D1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
H7C1D1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
H7C1D1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
H7C1D1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
H7C1D1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
H7C1D1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
H7C1D1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
H7C1D1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
H7C1D1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
H7C1D1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
H7C1D1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
H7C1D1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
H7C1D1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
H7C1D1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
H7C1D1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
H7C1D1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
H7C1D1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
H7C1D1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
H7C1D1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
H7C1D1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
H7C1D1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32■■■□□ 2.71
H7C1D1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
H7C1D1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
H7C1D1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
H7C1D1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
H7C1D1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
H7C1D1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
H7C1D1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
H7C1D1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
H7C1D1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
H7C1D1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
H7C1D1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
H7C1D1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
H7C1D1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
H7C1D1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
H7C1D1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
H7C1D1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
H7C1D1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
H7C1D1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
H7C1D1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
H7C1D1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
H7C1D1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
H7C1D1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
H7C1D1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
H7C1D1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
H7C1D1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
H7C1D1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
H7C1D1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
H7C1D1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
H7C1D1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
H7C1D1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
H7C1D1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
H7C1D1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
H7C1D1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
H7C1D1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
H7C1D1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
H7C1D1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
H7C1D1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
H7C1D1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
H7C1D1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
H7C1D1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
H7C1D1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
H7C1D1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
H7C1D1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
H7C1D1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
H7C1D1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
H7C1D1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
H7C1D1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
H7C1D1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
H7C1D1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
H7C1D1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
H7C1D1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
H7C1D1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
H7C1D1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
H7C1D1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
H7C1D1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
H7C1D1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
H7C1D1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
H7C1D1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
H7C1D1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
H7C1D1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
H7C1D1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
H7C1D1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
H7C1D1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
H7C1D1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
H7C1D1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
H7C1D1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
H7C1D1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
H7C1D1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms