Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C1C5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C1C5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C1C5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C1C5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C1C5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C1C5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C1C5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C1C5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C1C5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C1C5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C1C5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C1C5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C1C5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C1C5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C1C5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C1C5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C1C5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C1C5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C1C5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C1C5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C1C5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C1C5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C1C5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C1C5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C1C5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1C5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1C5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1C5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1C5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1C5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1C5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1C5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C1C5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C1C5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1C5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1C5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1C5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1C5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1C5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1C5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1C5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1C5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1C5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1C5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C1C5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C1C5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C1C5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C1C5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C1C5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C1C5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C1C5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C1C5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C1C5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C1C5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C1C5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C1C5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C1C5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C1C5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C1C5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C1C5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1C5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1C5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1C5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1C5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1C5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1C5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1C5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1C5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1C5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1C5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1C5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1C5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1C5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1C5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1C5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1C5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1C5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1C5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1C5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1C5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C1C5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1C5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1C5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1C5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1C5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C1C5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1C5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1C5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1C5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1C5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C1C5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1C5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1C5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1C5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1C5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1C5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1C5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C1C5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C1C5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms