Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C0C1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C0C1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C0C1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C0C1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C0C1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C0C1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C0C1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C0C1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C0C1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C0C1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C0C1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C0C1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C0C1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H7C0C1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H7C0C1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C0C1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C0C1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C0C1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C0C1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C0C1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C0C1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H7C0C1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
H7C0C1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
H7C0C1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H7C0C1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H7C0C1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H7C0C1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H7C0C1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H7C0C1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H7C0C1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H7C0C1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H7C0C1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H7C0C1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H7C0C1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H7C0C1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
H7C0C1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H7C0C1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H7C0C1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H7C0C1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H7C0C1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H7C0C1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H7C0C1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H7C0C1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H7C0C1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C0C1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C0C1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C0C1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C0C1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C0C1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C0C1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C0C1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C0C1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C0C1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C0C1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C0C1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C0C1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C0C1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C0C1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C0C1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C0C1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C0C1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C0C1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C0C1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C0C1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C0C1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C0C1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C0C1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C0C1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C0C1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C0C1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C0C1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H7C0C1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H7C0C1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H7C0C1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H7C0C1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H7C0C1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
H7C0C1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H7C0C1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H7C0C1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H7C0C1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H7C0C1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H7C0C1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H7C0C1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H7C0C1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H7C0C1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H7C0C1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H7C0C1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H7C0C1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
H7C0C1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H7C0C1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H7C0C1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H7C0C1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H7C0C1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H7C0C1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
H7C0C1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H7C0C1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H7C0C1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C0C1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C0C1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1095.6 ms