Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC179H3BU77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC179H3BU77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC179H3BU77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC179H3BU77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC179H3BU77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC179H3BU77 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC179H3BU77 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms