Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNH8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNH8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNH8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNH8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNH8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNH8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNH8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNH8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNH8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNH8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNH8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNH8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNH8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNH8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNH8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNH8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNH8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNH8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNH8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNH8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNH8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNH8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNH8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNH8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNH8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNH8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNH8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNH8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNH8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNH8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNH8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNH8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNH8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNH8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNH8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNH8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNH8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNH8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNH8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNH8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNH8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNH8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNH8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNH8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNH8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNH8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNH8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNH8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNH8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNH8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNH8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNH8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNH8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNH8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNH8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNH8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNH8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BNH8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BNH8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BNH8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNH8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNH8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNH8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNH8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNH8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BNH8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNH8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNH8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNH8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNH8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNH8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNH8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNH8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNH8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNH8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNH8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNH8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNH8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BNH8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BNH8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNH8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNH8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNH8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNH8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNH8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNH8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNH8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNH8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms