Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F8VVB4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F8VVB4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F8VVB4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F8VVB4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8VVB4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8VVB4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8VVB4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8VVB4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8VVB4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8VVB4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8VVB4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8VVB4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8VVB4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8VVB4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8VVB4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8VVB4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8VVB4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8VVB4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8VVB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8VVB4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8VVB4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8VVB4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F8VVB4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8VVB4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8VVB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8VVB4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8VVB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8VVB4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8VVB4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8VVB4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8VVB4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8VVB4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8VVB4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8VVB4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8VVB4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8VVB4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
F8VVB4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8VVB4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8VVB4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8VVB4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8VVB4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8VVB4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8VVB4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8VVB4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8VVB4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8VVB4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8VVB4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8VVB4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8VVB4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8VVB4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8VVB4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8VVB4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8VVB4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8VVB4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8VVB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8VVB4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8VVB4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8VVB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8VVB4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8VVB4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8VVB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8VVB4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F8VVB4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F8VVB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F8VVB4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F8VVB4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F8VVB4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8VVB4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
F8VVB4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8VVB4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8VVB4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8VVB4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F8VVB4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8VVB4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8VVB4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8VVB4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8VVB4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F8VVB4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8VVB4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8VVB4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F8VVB4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F8VVB4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F8VVB4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8VVB4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8VVB4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8VVB4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8VVB4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8VVB4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F8VVB4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F8VVB4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F8VVB4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F8VVB4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F8VVB4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F8VVB4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F8VVB4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F8VVB4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F8VVB4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F8VVB4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VVB4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms