Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
E9PCH4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
E9PCH4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
E9PCH4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
E9PCH4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
E9PCH4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
E9PCH4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
E9PCH4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
E9PCH4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
E9PCH4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
E9PCH4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
E9PCH4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
E9PCH4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
E9PCH4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
E9PCH4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
E9PCH4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
E9PCH4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
E9PCH4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
E9PCH4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
E9PCH4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
E9PCH4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
E9PCH4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
E9PCH4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
E9PCH4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
E9PCH4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
E9PCH4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
E9PCH4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
E9PCH4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
E9PCH4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
E9PCH4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
E9PCH4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
E9PCH4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.74■■■■□ 3.79
E9PCH4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
E9PCH4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
E9PCH4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
E9PCH4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
E9PCH4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
E9PCH4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
E9PCH4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
E9PCH4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
E9PCH4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
E9PCH4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
E9PCH4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
E9PCH4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
E9PCH4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
E9PCH4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
E9PCH4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
E9PCH4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
E9PCH4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
E9PCH4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
E9PCH4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
E9PCH4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
E9PCH4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
E9PCH4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
E9PCH4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
E9PCH4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
E9PCH4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
E9PCH4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
E9PCH4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
E9PCH4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
E9PCH4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
E9PCH4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
E9PCH4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
E9PCH4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
E9PCH4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
E9PCH4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
E9PCH4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
E9PCH4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
E9PCH4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
E9PCH4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
E9PCH4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
E9PCH4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms