Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4DXG7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4DXG7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4DXG7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DXG7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4DXG7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DXG7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B4DXG7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4DXG7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DXG7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DXG7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DXG7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DXG7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DXG7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DXG7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DXG7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DXG7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DXG7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DXG7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DXG7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DXG7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DXG7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DXG7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DXG7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DXG7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DXG7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DXG7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DXG7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DXG7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DXG7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DXG7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DXG7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DXG7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DXG7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DXG7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DXG7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DXG7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DXG7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DXG7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DXG7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DXG7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DXG7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DXG7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DXG7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DXG7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DXG7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DXG7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DXG7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DXG7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DXG7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DXG7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DXG7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DXG7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DXG7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DXG7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DXG7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4DXG7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4DXG7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DXG7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DXG7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DXG7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DXG7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DXG7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DXG7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DXG7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DXG7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4DXG7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4DXG7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
B4DXG7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4DXG7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4DXG7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4DXG7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4DXG7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
B4DXG7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
B4DXG7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4DXG7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
B4DXG7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4DXG7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4DXG7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4DXG7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4DXG7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4DXG7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4DXG7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4DXG7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4DXG7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4DXG7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4DXG7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
B4DXG7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B4DXG7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
B4DXG7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
B4DXG7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4DXG7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4DXG7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4DXG7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4DXG7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4DXG7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4DXG7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4DXG7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
B4DXG7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
B4DXG7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms