Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM229AB2RXF0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM229AB2RXF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM229AB2RXF0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM229AB2RXF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM229AB2RXF0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM229AB2RXF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM229AB2RXF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM229AB2RXF0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM229AB2RXF0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM229AB2RXF0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms