Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-6A8MVA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-6A8MVA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms