Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms