Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP73A6NFT4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP73A6NFT4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP73A6NFT4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP73A6NFT4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP73A6NFT4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms