Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6CA6NDK9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6CA6NDK9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6CA6NDK9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GOLGA6CA6NDK9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6CA6NDK9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms