Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PPC1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
A0A1W2PPC1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A1W2PPC1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PPC1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1W2PPC1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1W2PPC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A1W2PPC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
A0A1W2PPC1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms