Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A0U1RQJ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0U1RQJ8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0U1RQJ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A0U1RQJ8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0U1RQJ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms