Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV23-1A0A0A0MS06 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV23-1A0A0A0MS06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRBV23-1A0A0A0MS06 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV23-1A0A0A0MS06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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