Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WXM4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WXM4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WXM4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WXM4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087WXM4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WXM4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WXM4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WXM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A087WXM4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms