Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A087WSZ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WSZ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A087WSZ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WSZ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms