Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms