Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms