Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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