Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF330Q9Y3S2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF330Q9Y3S2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF330Q9Y3S2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF330Q9Y3S2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF330Q9Y3S2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF330Q9Y3S2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF330Q9Y3S2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms