Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms