Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms