Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms