Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHCHD3Q9NX63 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms