Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TBCCD1Q9NVR7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms