Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3GQ9NS98 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3GQ9NS98 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms