Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXO6Q9NRD1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FBXO6Q9NRD1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms