Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms