Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCLRE1BQ9H816 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCLRE1BQ9H816 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms