Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YTHDC2Q9H6S0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
YTHDC2Q9H6S0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
YTHDC2Q9H6S0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
YTHDC2Q9H6S0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
YTHDC2Q9H6S0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
YTHDC2Q9H6S0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YTHDC2Q9H6S0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms