Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTIF3Q9H2K0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MTIF3Q9H2K0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms